Στα πλαίσια της συνεργασίας της με πελάτες τόσο στο εσωτερικό όσο και στο εξωτερικό, η ATKOSoft έχει υπογράψει συμβάσεις υπηρεσιών Διοίκησης Έργων. Για παράδειγμα, η Ευρωπαϊκή Ένωση έχει, επί σειρά ετών, εμπιστευθεί την ATKOSoft τόσο με την απευθείας ανάθεση έργων πληροφορικής (π.χ. EUROSTAT) όσο και με την διοίκηση πανευρωπαϊκών κοινοπραξιών οι οποίες έχουν υλοποιήσει ή υλοποιούν έργα έρευνας και ανάπτυξης.

Στις περιπτώσεις αυτές, και για κάθε έργο, η ATKOSoft είναι υπεύθυνη για τις εξής δραστηριότητες:

• Συντονισμός εργασιών φορέων που συμμετέχουν στην υλοποίηση του έργου.

• Οικονομική διαχείριση του έργου.

• Ανάπτυξη Τεχνολογικής Στρατηγικής στην οποία βασίζεται η υλοποίηση του έργου.

• Συντονισμός προπαρασκευής και παράδοσης σε υπεύθυνους φορείς παραδοτέων που αφορούν στο έργο.

• Παρακολούθηση κρίσιμων ημερομηνιών (deadlines) σχετικών με την υλοποίηση του έργου.

• Επίλυση προβλημάτων τεχνολογικής ή διοικητικής υφής τα οποία προκύπτουν από την υλοποίηση έργων.

• Διοργάνωση συναντήσεων έργου.

• Συντονισμός δραστηριοτήτων διάχυσης των αποτελεσμάτων των έργων στην επιστημονική κοινότητα.

• Υιοθέτηση τυχόν διεθνών προτύπων κατά την υλοποίηση των έργων.

Συγκεκριμένα, η εταιρία έχει αναλάβει με επιτυχία το συντονισμό (project Management) για την υλοποίηση έργων υψηλού προϋπολογισμού και βαθμού πολυπλοκότητας, σε οργανισμούς όπως το Εθνικό Σύστημα Υγείας της Νότιας Ιρλανδίας, το Sahlgrenska University Hospital στην Σουηδία (το μεγαλύτερο νοσοκομείο της Ευρώπης), το Δημοτικό Σύστημα Υγείας της Τοσκάνης στην Ιταλία, το Νοσοκομείο Egas Moniz της Πορτογαλίας, το Office for National Statistics της Μεγάλης Βρετανίας, κλπ.